RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 CIDEBQ9UHD4 219 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL21Q9UJP4 597 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC23Q9UJX2 597 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRDM4Q9UKN5 801 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBX20Q9UMR3 447 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NENFQ9UMX5 172 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 STUB1Q9UNE7 303 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAMK2AQ9UQM7 478 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHKBQ9Y259 395 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CPQQ9Y646 472 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGAP23Q9P227 1491 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 LOC100509620A0A075B734 347 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0U1RQS6 177 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GUA9 196 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MACROD2A1Z1Q3 448 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM8BA6NDV4 472 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RRN3P2A6NIE6 340 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRC72A6NJI9 287 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 LIPT2A6NK58 231 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 A8MV72 311 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF487B1APH4 448 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 H3BQ06 376 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NBR2O15453 112 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSMD3O43242 534 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRTM2O43300 516 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFSF12O43508 249 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HS6ST1O60243 411 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYTIPO60759 359 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF253O75346 499 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MED24O75448 989 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RBBP9O75884 186 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SERF1AO75920 110 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 STBD1O95210 358 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMP10P09238 476 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPARCP09486 303 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 H2AFZP0C0S5 128 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RARGP13631 454 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRF2P14316 349 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 XBP1P17861 261 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 C4BPBP20851 252 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALML3P27482 149 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALDH3B1P43353 468 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSNK1DP48730 415 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCR5P51681 352 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HMGCS2P54868 508 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC12A3P55017 1021 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 F2RL1P55085 397 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARL4CP56559 192 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 OLR1P78380 273 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NIPAL4Q0D2K0 466 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 C17orf67Q0P5P2 114 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRYMQ14894 314 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 OPCMLQ14982 345 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM132DQ14C87 1099 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RASA2Q15283 850 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRR4Q16378 134 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 KYAT1Q16773 422 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM266Q2M3C6 531 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF311Q5JNZ3 666 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 EOGTQ5NDL2 527 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 C6orf136Q5SQH8 315 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCST2Q5T1A1 773 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDI2Q5TDH0 399 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 UGT3A1Q6NUS8 523 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC25A34Q6PIV7 304 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 KSR2Q6VAB6 950 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 BRD3OSQ6XYD6 125 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF600Q6ZNG1 722 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC24A5Q71RS6 500 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALNT13Q8IUC8 556 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARMC8Q8IUR7 673 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 LGI2Q8N0V4 545 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPC2Q8N158 579 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TCEANCQ8N8B7 351 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIML1Q8N9V2 468 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms