RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 NKG7Q16617 165 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB6CQ53S08 254 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 USP53Q70EK8 1073 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 Q8N402 240 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 LENG9Q96B70 501 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SCRN2Q96FV2 425 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 WBP1Q96G27 269 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 DOCK2Q92608 1830 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SIX6O95475 246 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV2-70P01814 119 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 NDUFB7P17568 137 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP12AP54707 1039 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 DCDC1P59894 354 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TNFRSF17Q02223 184 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PICALMQ13492 652 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 BICRALQ6AI39 1079 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF527Q8NB42 609 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 NETO2Q8NC67 525 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 BVESQ8NE79 360 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 OR2T4Q8NH00 348 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SFXN2Q96NB2 322 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRC3Q9BY71 257 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 HCN1O60741 890 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PAGE1O75459 146 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 C1RP00736 705 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 VIPP01282 170 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SYPP08247 313 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 BMP8BP34820 402 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC19A1P41440 591 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 CLCN5P51795 746 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRC32Q14392 662 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 CHRNA6Q15825 494 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PEBP4Q96S96 227 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 CGRRF1Q99675 332 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 BTG4Q9NY30 223 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 GPR83Q9NYM4 423 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 GPR160Q9UJ42 338 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 NIPSNAP2O75323 286 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 GADD45GO95257 159 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 S100A8P05109 93 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PDGFRAP16234 1089 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 CD53P19397 219 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP4BP51164 291 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 DIO3P55073 304 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 STX4Q12846 297 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 ERV3-1Q14264 604 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 TCTE1Q5JU00 501 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 FUT10Q6P4F1 479 aa8.25□□□□□ -1.09
NHLRC3-201ENST00000379599 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms