RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 RASGRP1O95267 797 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 CD247P20963 164 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ATP4BP51164 291 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SLC36A3Q495N2 470 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 LGALS12Q96DT0 336 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SLC39A13Q96H72 371 aa14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PDYNP01213 254 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 APODP05090 189 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ALPPL2P10696 532 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 BCKDHAP12694 445 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PRPS1L1P21108 318 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PTPN5P54829 565 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 RAB14P61106 215 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 IL18R1Q13478 541 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 IER5LQ5T953 404 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ZFP90Q8TF47 636 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 EHD1Q9H4M9 534 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PCTPQ9UKL6 214 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 CARNS1A5YM72 827 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 H0YAE9 185 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 M0QX08 132 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SLC1A7O00341 560 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 AP1G1O43747 822 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ITGA2P17301 1181 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 DNAJB1P25685 340 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 HTR1EP28566 365 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SHMT2P34897 504 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 VEGFBP49765 207 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 CLCN2P51788 898 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 BEND5Q7L4P6 421 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 CD200R1Q8TD46 325 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 TMEM203Q969S6 136 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 NUS1Q96E22 293 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 NUDT14O95848 222 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 IDSP22304 550 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 HTR1BP28222 390 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 VIPR1P32241 457 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 OR1E2P47887 323 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 TUBA3CQ13748 450 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ZNF404Q494X3 552 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ART5Q96L15 291 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 A0A1W2PRB8 838 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 GLOD5A6NK44 160 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 B4GALT3O60512 393 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 IFNA16P05015 189 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 EBLN1P0CF75 366 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 GPM6BQ13491 265 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 CDK20Q8IZL9 346 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 DPP10Q8N608 796 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PKP4Q99569 1192 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SERHLQ9NQF3 203 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.89□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PLOD3O60568 738 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SERPINB7O75635 380 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 VIPP01282 170 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PRMT2P55345 433 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 RAPSNQ13702 412 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 APOFQ13790 326 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 DSC3Q14574 896 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 RAB43Q86YS6 212 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PYURFQ96I23 114 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 VAPAQ9P0L0 249 aa14.88□□□□□ -0.03
FGD1-201ENST00000375135 PI15O43692 258 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms