RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 LOC100509620A0A075B734 347 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DISC1C4P0D8 188 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RAB36O95755 333 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 EDNRAP25101 427 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 EIPR1Q53HC9 387 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF18BQ86Y91 864 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DENND6BQ8NEG7 585 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 J3QLW9 94 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC1A7O00341 560 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF19P17023 458 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ELOA3BQ3SY89 546 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 XKR4Q5GH76 650 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 C6orf136Q5SQH8 315 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PHC3Q8NDX5 983 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ELOA3Q8NG57 546 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SRRDQ9UH36 339 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PIK3C2AO00443 1686 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 KAT6AQ92794 2004 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CLCA1A8K7I4 914 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRN3E7EW58 273 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PSMD9O00233 223 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 BCHEP06276 602 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 VLDLRP98155 873 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DCDC5Q6ZRR9 648 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NXPE1Q8N323 547 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DERL2Q9GZP9 239 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LHPPQ9H008 270 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRN3Q9H3W5 708 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 P2RX2Q9UBL9 471 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CYTH4Q9UIA0 394 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LCHNA4D1U4 455 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC35F4A4IF30 521 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC19A2O60779 497 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TACSTD2P09758 323 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 APLP1P51693 650 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SAMD12Q8N8I0 201 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OR8J3Q8NGG0 315 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OR8D1Q8WZ84 308 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FZD8Q9H461 694 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IRAK2O43187 625 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DSG2Q14126 1118 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NDUFA9Q16795 377 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 KLHL26Q53HC5 615 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LIPKQ5VXJ0 399 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ASB3Q9Y575 518 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM170BA6NMN3 283 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 KRT33AO76009 404 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NR4A2P43354 598 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GDI2P50395 445 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM46CQ5VWP2 391 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PI15O43692 258 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CRYZL1O95825 349 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PIGRP01833 764 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CKMT1AP12532 417 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 BMP2P12643 396 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PGAM2P15259 253 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKACBP22694 351 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 HTR1BP28222 390 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP3K8P41279 467 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GDF5P43026 501 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PTGR1Q14914 329 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A25Q6KCM7 469 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF767PQ75MW2 155 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC32Q9BV29 185 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IFT52Q9Y366 437 aa18.06■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF3P17036 446 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NFE2L1Q14494 772 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CILP2Q8IUL8 1156 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms