RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4B1P13584 511 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PCSK2P16519 638 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPN2P17706 415 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 SDC1P18827 310 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PRPH2P23942 346 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 CDKN2CP42773 168 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 DCDC1P59894 354 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PFN3P60673 137 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2H3Q13889 308 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 INAQ16352 499 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINA11Q86U17 422 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 RASGRP3Q8IV61 690 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 MASP1P48740 699 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 VBP1P61758 197 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 IFITM3Q01628 133 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 POM121L1PQ3SYA9 428 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PGBD3Q8N328 593 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 CMTM7Q96FZ5 175 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 EGLN2Q96KS0 407 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 RFXANKO14593 260 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 FPR1P21462 350 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 TGM1P22735 817 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK1P28482 360 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 WEE1P30291 646 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 AP1S2P56377 157 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PGS1Q32NB8 556 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PAGE2BQ5JRK9 111 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 FRG2Q64ET8 278 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 LAIR1Q6GTX8 287 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 DOK6Q6PKX4 331 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 FRG2BQ96QU4 278 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.08■■□□□ 1.29
AMIGO1-201ENST00000369862 RGS10O43665 173 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 LRATO95237 230 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 MT-ND2P03891 347 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 BMP4P12644 408 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMB9P28065 219 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 LSM3P62310 102 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 IL1RL1Q01638 556 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 CHIT1Q13231 466 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 LAPTM4AQ15012 233 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC81Q6ZN84 652 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF540Q8NDQ6 660 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 ASZ1Q8WWH4 475 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXJ1Q92949 421 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 APOLD1Q96LR9 279 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 HHIPQ96QV1 700 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPAN11A1L157 253 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 EVPLLA8MZ36 301 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 KPNA5O15131 536 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 SLCO2B1O94956 709 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 CD22P20273 847 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDH4A1P30038 563 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 PRSS48Q7RTY5 328 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAM1L1Q8N609 369 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 ACOT13Q9NPJ3 140 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 AASSQ9UDR5 926 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 SEMG1P04279 462 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 AMD1P17707 334 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC14A1Q13336 389 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 DGCR6Q14129 220 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF366Q8N895 744 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 IL23AQ9NPF7 189 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D14Q9P2M4 693 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS6KA6Q9UK32 745 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF33A8MVX0 844 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 NPIPB8E9PQR5 432 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 AP2A2O94973 939 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-201ENST00000369862 FABP3P05413 133 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms