RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 FKBP6O75344 327 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 JRKO75564 520 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZFAND5O76080 213 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 UFL1O94874 794 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 KLHL2O95198 593 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MOCS3O95396 460 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 VCLP18206 1134 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CDH3P22223 829 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PON1P27169 355 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 FOXN2P32314 431 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CCR3P51677 355 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 PTENP60484 403 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 NAA20P61599 178 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CDK16Q00536 496 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 DR1Q01658 176 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 DMPKQ09013 629 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 WASHC5Q12768 1159 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ASPHQ12797 758 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 STARD3Q14849 445 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 OXA1LQ15070 435 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ8Q15842 424 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MOB3CQ70IA8 216 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 CDKL2Q92772 493 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 BORCS5Q969J3 196 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 GIMAP5Q96F15 307 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 LINGO1Q96FE5 620 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PAGE5Q96GU1 130 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MS4A14Q96JA4 679 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 C8orf48Q96LL4 319 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 CUEDC2Q9H467 287 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 GID8Q9NWU2 228 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 THEGQ9P2T0 379 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 SIPA1L1O43166 1804 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ACEP12821 1306 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 HEG1Q9ULI3 1381 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 OR5K3A6NET4 321 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 BET1O15155 118 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 FAM155BO75949 473 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 APOEP02649 317 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 HOXB7P09629 217 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 PRKACBP22694 351 aa3.41□□□□□ -1.86
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