RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BNIP1Q12981 228 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GRIK3Q13003 919 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNC3Q14003 757 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SSX2Q16385 188 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN26Q16670 478 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SOWAHAQ2M3V2 549 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 Q4G0T1 1027 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC121Q6ZUS5 278 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RTN4RL2Q86UN3 420 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GPBP1Q86WP2 473 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CLYBLQ8N0X4 340 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OR9A1PQ8NGU1 263 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HEXDCQ8WVB3 486 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LOXL4Q96JB6 756 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA33Q96N06 139 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NPY6RQ99463 290 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OLFM1Q99784 485 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNS3Q9BQ31 491 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RNF32Q9H0A6 362 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NANSQ9NR45 359 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ABCB10Q9NRK6 738 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf18Q9UK00 162 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PACSIN3Q9UKS6 424 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TFR2Q9UP52 801 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC8A2Q9UPR5 921 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ICKQ9UPZ9 632 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 L3MBTL1Q9Y468 752 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NME7Q9Y5B8 376 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0C4DFX4 3053 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MGAQ8IWI9 3026 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HMX2A2RU54 273 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRPC5OSA6NMA1 111 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TTC34A8MYJ7 566 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD11O00231 422 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRYO14603 147 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TPST2O60704 377 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5HO75947 161 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KRT75O95678 551 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 APOA1P02647 267 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ELANEP08246 267 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EPB41P11171 864 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SSTR4P31391 388 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARR3P36575 388 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GDNFP39905 211 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMPOP42166 694 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CDKN1BP46527 198 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CDH11P55287 796 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GSDMDP57764 484 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IL9RQ01113 521 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ASPHQ12797 758 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DGCR6Q14129 220 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZMYND11Q15326 602 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF618Q5T7W0 954 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CD300LGQ6UXG3 332 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IZUMO1Q8IYV9 350 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GPR135Q8IZ08 494 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MCPH1Q8NEM0 835 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GAL3ST1Q99999 423 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf80Q9BSJ5 609 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK13Q9HB14 408 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MSL2Q9HCI7 577 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PARPBPQ9NWS1 579 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GGA2Q9UJY4 613 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADAM21Q9UKJ8 722 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SNX7Q9UNH6 387 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ASF1AQ9Y294 204 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PDZD2O15018 2839 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PP64 1363 aa2.4□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0U1RQV5 110 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KLRF2D3W0D1 207 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ADAM12O43184 909 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PPIP5K2O43314 1243 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RAD17O75943 681 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNA1P02708 482 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CSF2RAP15509 400 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CHRM3P20309 590 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms