RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 OR5K3A6NET4 321 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GLOD5A6NK44 160 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 WASH4PA8MWX3 477 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GNGT2O14610 69 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1DO15297 605 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RDH16O75452 317 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LRATO95237 230 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV3-27P01718 113 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CEACAM5P06731 702 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS56P0CW18 603 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CD59P13987 128 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LHCGRP22888 699 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ACRV1P26436 265 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF8P28908 595 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B3P37058 310 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 VASPP50552 380 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LIMK2P53671 638 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MLLT10P55197 1068 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 AP1S2P56377 157 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FOXK1P85037 733 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PTSQ03393 145 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf80Q0P641 193 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC29A2Q14542 456 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CRYMQ14894 314 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ACSBG2Q5FVE4 666 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 AFMIDQ63HM1 303 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IFNEQ86WN2 208 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf44Q96CB5 159 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RABEP2Q9H5N1 569 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CFL2Q9Y281 166 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NUP205Q92621 2012 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8OA6NCC3 632 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRR19A6NJB7 356 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8NF8WBI6 632 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SGK494L7N484 410 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 B4GAT1O43505 415 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF10O60809 474 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZMPSTE24O75844 475 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM63AO94886 807 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 WNT1P04628 370 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF883P0CG24 379 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UQCRC1P31930 480 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GDF5P43026 501 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 BIKQ13323 160 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM181AQ8N9Y4 354 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR2L2Q8NH16 312 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPR151Q8TDV0 419 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A11Q8WWX8 675 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CAVIN3Q969G5 261 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OLFM3Q96PB7 478 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MENTQ9BUN1 341 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB11Q9BUY7 163 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FUT8Q9BYC5 575 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR51B5Q9H339 312 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IPPKQ9H8X2 491 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OLAHQ9NV23 265 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EURLQ9NYK6 297 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SOX13Q9UN79 622 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP8B1O43520 1251 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SYNGR4O95473 234 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OTCP00480 354 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF28P17035 718 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HRH2P25021 359 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CASP9P55211 416 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RAB10P61026 200 aa4.26□□□□□ -1.73
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