RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 AGRPO00253 132 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ITM2AO43736 263 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 MSL3P1P0C860 447 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 UROSP10746 265 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CD22P20273 847 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SERPINB1P30740 379 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 AHRP35869 848 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SCTRP47872 440 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 PDX1P52945 283 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CLDN6P56747 220 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 GUCY1A3Q02108 690 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FOXM1Q08050 763 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 OR7G3Q8NG95 312 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CCT6BQ92526 530 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FGF21Q9NSA1 209 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.25■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 EFCAB7A8K855 629 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TXNDC9O14530 226 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FFAR3O14843 346 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 AZIN1O14977 448 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 GPR42O15529 346 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 NRP2O60462 931 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ULK1O75385 1050 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SERPIND1P05546 499 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FOLR1P15328 257 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 BCL6P41182 706 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TUBB3Q13509 450 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TCTE1Q5JU00 501 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FRG2Q64ET8 278 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 LAS2Q8IYD9 372 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 GPR135Q8IZ08 494 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 AGR3Q8TD06 166 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FRG2BQ96QU4 278 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 OR2A5Q96R48 311 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SPNS1Q9H2V7 528 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ZNF225Q9UK10 706 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.24■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 A0A1B0GTL3 188 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FGF4P08620 206 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CES4AQ5XG92 561 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 OR8K5Q8NH50 307 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 OR6C1Q96RD1 312 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 RARRES3Q9UL19 164 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.23■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 H0YGG7 62 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 JMJD7P0C870 316 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 PIK3CBP42338 1070 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 RGS1Q08116 209 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 IL11RAQ14626 422 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 GPR19Q15760 415 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SGO1Q5FBB7 561 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ASPGQ86U10 573 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 RHBGQ9H310 441 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TIMM22Q9Y584 194 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 CACNA1AO00555 2505 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 B4E171 279 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 NDUFS4O43181 175 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 OR2B3O76000 313 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ARRB2P32121 409 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 TSPAN7P41732 249 aa20.22■□□□□ 0.83
YBX1-201ENST00000321358 ITGA1P56199 1179 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms