RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ABATP80404 500 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0040Q15053 153 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC6Q16204 474 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ALG11Q2TAA5 492 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATS1Q496A3 300 aa9.73□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.73□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.73□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NT5DC2Q9H857 520 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.73□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TAC3Q9UHF0 121 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF15Q9UIH9 416 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MUI8 341 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD28O15084 1053 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SCAMP1O15126 338 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRMT3O60678 531 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ENTPD5O75356 428 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SHMT2P34897 504 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXM1Q08050 763 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NUMA1Q14980 2115 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 PJA1Q8NG27 643 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 VPS33AQ96AX1 596 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC58Q96CX6 371 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX37Q96LM6 180 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PIPSLA2A3N6 862 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 H7BY64 318 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 ASMTP46597 345 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-201ENST00000319942 MTAPQ13126 283 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NFYCQ13952 458 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGR1Q14914 329 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TLR1Q15399 786 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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