RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ATL1Q8WXF7 558 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CMTM7Q96FZ5 175 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 RNF145Q96MT1 663 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CENPKQ9BS16 269 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 RHBGQ9H310 441 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 FGF22Q9HCT0 170 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 EXD2Q9NVH0 621 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 UBAP1Q9NZ09 502 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 TAC3Q9UHF0 121 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 H0YIV9 168 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SCN2BO60939 215 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 KCNH1O95259 989 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 EML2O95834 649 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 DNTTP04053 509 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CEACAM5P06731 702 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CDH1P12830 882 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 S100A3P33764 101 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PNLIPRP1P54315 467 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 KLC1Q07866 573 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ACSM2AQ08AH3 577 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SGCGQ13326 291 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 MADCAM1Q13477 382 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CLCA4Q14CN2 919 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ACSM2BQ68CK6 577 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SYT12Q8IV01 421 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 GATA6Q92908 595 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 COL26A1Q96A83 441 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 BIRC7Q96CA5 298 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ZBTB18Q99592 522 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 TEX101Q9BY14 249 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 DPEP2Q9H4A9 486 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 KLHL3Q9UH77 587 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SNX8Q9Y5X2 465 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 A0A1B0GTW7 788 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 DPPA5A6NC42 116 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 GRXCR2A6NFK2 248 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 GABRR3A8MPY1 467 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 H7BY64 318 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SOAT1P35610 550 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 WNT3P56703 355 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PLCL1Q15111 1095 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 NKG7Q16617 165 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 LCN8Q6JVE9 175 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 WDR48Q8TAF3 677 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 MENTQ9BUN1 341 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SGPP1Q9BX95 441 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SUFUQ9UMX1 484 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SOCS2O14508 198 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 KLHL18O94889 574 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ADH1BP00325 375 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 IL6P05231 212 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 UQCRBP14927 111 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 IST1P53990 364 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PRKCQQ04759 706 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 BLMHQ13867 455 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 Q6ZS52 159 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 PDZD3Q86UT5 571 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 GPR180Q86V85 440 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.45□□□□□ -1.54
USP15-201ENST00000280377 C12orf66Q96MD2 445 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms