RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 F5P12259 2224 aa14.75□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 PELI2Q9HAT8 420 aa14.73□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.73□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 LRRC72A6NJI9 287 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 RFXANKO14593 260 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 FPGTO14772 594 aa14.72□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 CKMT2P17540 419 aa14.72□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.059e-7■■■■□ 22.6
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SF3B4-201ENST00000271628 KIAA1024LP59773 190 aa14.72□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 FAM124AQ86V42 546 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 TRPV3Q8NET8 790 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 OR2T12Q8NG77 320 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 CCDC115Q96NT0 180 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B4-201ENST00000271628 FZD3Q9NPG1 666 aa14.72□□□□□ -0.05
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