RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 FAM117AQ9C073 453 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RAB21Q9UL25 225 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TRBC2A0A5B9 178 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FOXO6A8MYZ6 492 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FOXS1O43638 330 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SUPT3HO75486 399 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RECKO95980 971 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 AGXTP21549 392 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SCTRP47872 440 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 OR1D4P47884 311 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FOXL2P58012 376 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 REEP5Q00765 189 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CDC16Q13042 620 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A5Q14940 896 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NCF4Q15080 339 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TDRPQ86YL5 185 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MOCOSQ96EN8 888 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC11Q9NVH1 559 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TCFL5Q9UL49 500 aa21.23■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 GNAZP19086 355 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RPS15P62841 145 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CDC20Q12834 499 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 IL10RAQ13651 578 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MUM1Q2TAK8 710 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 GARNL3Q5VVW2 1013 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CAVIN3Q969G5 261 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CCDC77Q9BR77 488 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 GPRC5BQ9NZH0 403 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TBK1Q9UHD2 729 aa21.22■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPM1 405 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SYCE1LA8MT33 242 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC9O14530 226 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 OR1F1O43749 312 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 PRKAR1AP10644 381 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CD22P20273 847 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 E2F2Q14209 437 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ERV3-1Q14264 604 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SETDB1Q15047 1291 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RASA2Q15283 850 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 LINC00303Q3SY05 128 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MLIPQ5VWP3 458 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ATG9BQ674R7 924 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 KLC3Q6P597 504 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 EMBQ6PCB8 327 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 OVCH1Q7RTY7 1134 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SLC13A3Q8WWT9 602 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 WDR34Q96EX3 536 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CABS1Q96KC9 395 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 COPG2Q9UBF2 871 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MAU2Q9Y6X3 613 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 PCSK5Q92824 1860 aa21.21■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FAM208BQ5VWN6 2430 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 RBP1P09455 135 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 NUDT17P0C025 328 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 GRK3P35626 688 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SLCO1A2P46721 670 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 MC1RQ01726 317 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PCDH1Q08174 1060 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TBR1Q16650 682 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PFKFB4Q16877 469 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 C16orf46Q6P387 395 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SYVN1Q86TM6 617 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ASPGQ86U10 573 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SHISA5Q8N114 240 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 KCT2Q8NC54 265 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 OR2W6PQ8NHA6 318 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A1Q9H2B4 701 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 XPR1Q9UBH6 696 aa21.2■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SCN3AQ9NY46 2000 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 WFS1O76024 890 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 AHRP35869 848 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms