RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641281.1

CCDC196-208, Transcript of coiled-coil domain containing 196, humanhuman

Gene CCDC196, Length 1,018 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196-208ENST00000641281 ONECUT2O95948 504 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PRLP01236 227 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 GABRA4P48169 554 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 AP2B1P63010 937 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SEC16AO15027 2179 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ANKRD62A6NC57 917 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 MMEP08473 750 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 COX6A1P12074 109 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 DESP17661 470 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 BMP7P18075 431 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 CXCR2P25025 360 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PON1P27169 355 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PEX19P40855 299 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 KLC1Q07866 573 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ZIC1Q15915 447 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SPESP1Q6UW49 350 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 COX15Q7KZN9 410 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC196-208ENST00000641281 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 EID2BQ96D98 161 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 VPS35Q96QK1 796 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SARGQ9BW04 601 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 C3orf18Q9UK00 162 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 CBLCQ9ULV8 474 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 BICDL2A1A5D9 508 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 A8MUI8 341 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PRPSAP2O60256 369 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SMC2O95347 1197 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 SLC4A1P02730 911 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 CELA2AP08217 269 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ITGAMP11215 1152 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 ZNF24P17028 368 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 CD53P19397 219 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 PPP1R2P41236 205 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 OR1D4P47884 311 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 KRT85P78386 507 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 DSC2Q02487 901 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC196-208ENST00000641281 IHHQ14623 411 aa6.67□□□□□ -1.34
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