RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PKP4	Q99569	1192 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP26	Q9BV47	211 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	IL36A	Q9UHA7	158 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CDH7	Q9ULB5	785 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GABRR3	A8MPY1	467 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ATG13	O75143	517 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SEC14L2	O76054	403 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	IMPA1	P29218	277 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	EPHA2	P29317	976 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGDIA	P52565	204 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF691	Q5VV52	312 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PTOV1	Q86YD1	416 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TANK	Q92844	425 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NEIL2	Q969S2	332 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CSF3R	Q99062	836 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V1G1	O75348	118 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	INMT	O95050	263 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TRPC1	P48995	793 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DAP	P51397	102 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	OR7G3	Q8NG95	312 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	HHIP	Q96QV1	700 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MGAT4D	A6NG13	374 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PLK4	O00444	970 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MYO1D	O94832	1006 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FABP3	P05413	133 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GSTM2	P28161	218 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA2	P43356	314 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GSS	P48637	474 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MESP2	Q0VG99	397 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	STARD3	Q14849	445 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CPTP	Q5TA50	214 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	LIPI	Q6XZB0	460 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	NODAL	Q96S42	347 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FZD4	Q9ULV1	537 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152		K7ESM1	405 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	AP2A2	O94973	939 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ANGPTL1	O95841	491 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00271	P0C7V0	271 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GPX2	P18283	190 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CDK5R2	Q13319	367 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RASSF1	Q9NS23	344 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152		H3BM21	787 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-E	P13747	358 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN2	P17706	415 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DCDC1	P59894	354 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GAB1	Q13480	694 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	IER5L	Q5T953	404 aa		12.63	□□□□□ -0.39

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