RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRE2Q9UHX3 823 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-215ENST00000628018 PPT2Q9UMR5 302 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-215ENST00000628018 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa23.87■■□□□ 1.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 GSAPA4D1B5 854 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5K3A6NET4 321 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 NRP2O60462 931 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 GIMD1P0DJR0 217 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 JAK1P23458 1154 aa23.86■■□□□ 1.41
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