RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611640.4

KDM4B-211, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene KDM4B, Length 5,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-211ENST00000611640 SP140Q13342 867 aa16.08■□□□□ 0.17
KDM4B-211ENST00000611640 ATP6AP1Q15904 470 aa16.08■□□□□ 0.17
KDM4B-211ENST00000611640 XKR5Q6UX68 686 aa16.08■□□□□ 0.17
KDM4B-211ENST00000611640 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.08■□□□□ 0.17
KDM4B-211ENST00000611640 AASSQ9UDR5 926 aa16.08■□□□□ 0.17
KDM4B-211ENST00000611640 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.08■□□□□ 0.17
KDM4B-211ENST00000611640 RNF6Q9Y252 685 aa16.08■□□□□ 0.17
KDM4B-211ENST00000611640 OR14I1A6ND48 311 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF30P17039 623 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 AHCYP23526 432 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 C14orf80Q86SX3 495 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 SUN5Q8TC36 379 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 AGR2O95994 175 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 CD72P21854 359 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 CLCN7P51798 805 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 TLR1Q15399 786 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 GPR68Q15743 365 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 TECRLQ5HYJ1 363 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 GHDCQ8N2G8 530 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 TSPEARQ8WU66 669 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ISOC1Q96CN7 298 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 DCLK1O15075 740 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF432O94892 652 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 RENP00797 406 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PHC1P78364 1004 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 GRHL3Q8TE85 626 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ZFAND2BQ8WV99 257 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 LAPTM4AQ15012 233 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 POF1BQ8WVV4 589 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 C1orf74Q96LT6 269 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF382Q96SR6 550 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 CYTH4Q9UIA0 394 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 CDH7Q9ULB5 785 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PHF24Q9UPV7 400 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.08■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 EPOP01588 193 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 S100A6P06703 90 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 LINGO3P0C6S8 592 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 CD1DP15813 335 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ELK4P28324 431 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.165e-7■■□□□ 14.5
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF404Q494X3 552 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 CYBRD1Q53TN4 286 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 KCT2Q8NC54 265 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 NDUFS4O43181 175 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 DGKEP52429 567 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 TAS2R50P59544 299 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ABHD13Q7L211 337 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 NKD1Q969G9 470 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 TMED9Q9BVK6 235 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 FAM170BA6NMN3 283 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ADAM8P78325 824 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 OR2L5Q8NG80 312 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PMEPA1Q969W9 287 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 PLOD2O00469 737 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 F2P00734 622 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 MC1RQ01726 317 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ELOA3Q8NG57 546 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 GAL3ST1Q99999 423 aa16.07■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.06■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 NFKBIEO00221 500 aa16.06■□□□□ 0.16
KDM4B-211ENST00000611640 ENTPD6O75354 484 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms