RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLK8O60259 260 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NME2P1O60361 137 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAN1A2O60476 641 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CTAG2O75638 210 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 APOC2P02655 101 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NME2P22392 152 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOXN2P32314 431 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EFNA3P52797 238 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PMPCAQ10713 525 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACAD11Q709F0 780 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOPNLQ96NB1 174 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPAS2Q99743 824 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARD6Q9BX69 1037 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF358Q9NW07 568 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IQCF5A8MTL0 148 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDK2AP1O14519 115 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NDC80O14777 642 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PROM1O43490 865 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C1orf105O95561 183 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCNFP41002 786 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BDKRB1P46663 353 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CYB561P49447 251 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTK6Q13882 451 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM53BQ14153 422 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C18orf12Q96KH6 178 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA13Q96N96 652 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LPAR4Q99677 370 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMR3AQ99954 134 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A1W2PPV9 198 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HS6ST1O60243 411 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TFEBP19484 476 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AOAHP28039 575 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XCR1P46094 333 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BBS12Q6ZW61 710 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LGI4Q8N135 537 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MDFIQ99750 246 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NFS1Q9Y697 457 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HCFC1P51610 2035 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0U1RQJ8 604 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRT87PA6NCN2 255 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 H0YIG0 161 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GYPCP04921 128 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 INHBBP09529 407 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBP3P10745 1247 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RFC3P40938 356 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUP107P57740 925 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SFT2D3Q587I9 215 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PAOXQ6QHF9 649 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADCK2Q7Z695 626 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRT222Q8N1A0 295 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACTL9Q8TC94 416 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUDT8Q8WV74 236 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PWWP2AQ96N64 755 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms