RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 ANXA5P08758 320 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 COX6A1P12074 109 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 EMP2P54851 167 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 HIF1AQ16665 826 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 BBS9Q3SYG4 887 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PLD3Q8IV08 490 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 C8orf44Q96CB5 159 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CERS2Q96G23 380 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PARVBQ9HBI1 364 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.11■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 SEMA7AO75326 666 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CDKN2DP55273 166 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 MORF4L2Q15014 288 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NR6A1Q15406 480 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NDUFA9Q16795 377 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PAQR3Q6TCH7 311 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PALM2Q8IXS6 379 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 FFAR3O14843 346 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 GPR42O15529 346 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CBX6O95503 412 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 AHSGP02765 367 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 FDXRP22570 491 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 MFAP5Q13361 173 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PDIK1LQ8N165 341 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 THAP11Q96EK4 314 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 LINGO1Q96FE5 620 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 LMF1Q96S06 567 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 SGPP1Q9BX95 441 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.09■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NOTCH2Q04721 2471 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 TEX15Q9BXT5 2789 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 TSPAN12O95859 305 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CCND1P24385 295 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CXCR2P25025 360 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 CSNK1G2P78368 415 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 PHKG1Q16816 387 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 STEAP4Q687X5 459 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 C17orf64Q86WR6 236 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MBD3-211ENST00000592965 SCN2AQ99250 2005 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 H0YIG0 161 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 HEXBP07686 556 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 AVPR1BP47901 424 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 GLRBP48167 497 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CREG2Q8IUH2 290 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 LRRC39Q96DD0 335 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22.07■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 USP27XA6NNY8 438 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 KLHL18O94889 574 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 SERPINA7P05543 415 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CYC1P08574 325 aa22.06■■□□□ 1.12
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