RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 ASB11Q8WXH4 323 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 CERS2Q96G23 380 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 CENPHQ9H3R5 247 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 CTSFQ9UBX1 484 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 MAST4O15021 2626 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC25A39-216ENST00000592857 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 HYKKA2RU49 373 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TTLL8A6PVC2 850 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 GFYI3L273 518 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PEX12O00623 359 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 DPM1O60762 260 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CDH16O75309 829 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PIAS1O75925 651 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 OR1D4P47884 311 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PNLIPRP1P54315 467 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 NAA25Q14CX7 972 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PRTGQ2VWP7 1150 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 KCNMB4Q86W47 210 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PAQR7Q86WK9 346 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 GALNT16Q8N428 558 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CALML6Q8TD86 181 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 INPP5DQ92835 1189 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PGM2Q96G03 612 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 C10orf90Q96M02 699 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PAFAH2Q99487 392 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM167BQ9BTA0 163 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TAC3Q9UHF0 121 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 E7ENX8 843 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SOCS6O14544 535 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 IGHEP01854 428 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MMP11P24347 488 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 HSD17B2P37059 387 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SOX8P57073 446 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TAP2Q03519 686 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MGAT5Q09328 741 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MYBPC3Q14896 1274 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 RASA2Q15283 850 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ICE2Q659A1 982 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC6A19Q695T7 634 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF425Q6IV72 752 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 NACC2Q96BF6 587 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MFRPQ9BY79 579 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 LUZP4Q9P127 313 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 C5AR2Q9P296 337 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CYSRT1A8MQ03 144 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 H0YGG7 62 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 GABRB3P28472 473 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MSH2P43246 934 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ATCAYQ86WG3 371 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PPM1NQ8N819 430 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms