RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 NR4A3Q92570 626 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 TCF12Q99081 682 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 DRC3Q9H069 523 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 APCP25054 2843 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 ENO4A6NNW6 628 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 E5RI56 91 aa11.47□□□□□ -0.57
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CTIF-208ENST00000590422 CXCR2P25025 360 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 MST1P26927 711 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CXCR5P32302 372 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CDK16Q00536 496 aa11.47□□□□□ -0.57
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CTIF-208ENST00000590422 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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CTIF-208ENST00000590422 TTC27Q6P3X3 843 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CASC4Q6P4E1 433 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 TMEM205Q6UW68 189 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 C4orf22Q6V702 233 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 ADCK2Q7Z695 626 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 HAS2Q92819 552 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 MARVELD3Q96A59 401 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 SNX12Q9UMY4 172 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.47□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 OR2W5A6NFC9 320 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 H7BY64 318 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CCNDBP1O95273 360 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 IMPA1P29218 277 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 SLC1A2P43004 574 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 PMP22Q01453 160 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 GPS1Q13098 491 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CTBP1Q13363 440 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 INAQ16352 499 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 NEK10Q6ZWH5 1172 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CD200R1Q8TD46 325 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 ASB11Q8WXH4 323 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 PBKQ96KB5 322 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 IMMP1LQ96LU5 166 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.46□□□□□ -0.57
CTIF-208ENST00000590422 CACNA1CQ13936 2221 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GUH1 482 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 PRSS44E7EML9 344 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 GFYI3L273 518 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 CES2O00748 559 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 PFDN6O15212 129 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 CEP104O60308 925 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 WFS1O76024 890 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 UNC5CO95185 931 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 UQCRHP07919 91 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.45□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
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