RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 FZD4Q9ULV1 537 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP10O43572 662 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 XPAP23025 273 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 ERAP2Q6P179 960 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 CMTM7Q96FZ5 175 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX11Q9Y5W9 270 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM221BA6H8Z2 402 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 C9JVG2 144 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 EPORP19235 508 aa24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 RABL3Q5HYI8 236 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 TMTC4Q5T4D3 741 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPJQ5W064 366 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A7Q6PXP3 512 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 RFLNAQ6ZTI6 216 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF765Q7L2R6 523 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 GLRX5Q86SX6 157 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 GANCQ8TET4 914 aa24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 MMP12P39900 470 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA14Q0VDF9 509 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 TEAD4Q15561 434 aa24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLK13Q9UKR3 277 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC22BO75396 215 aa24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TIPRLO75663 272 aa24.58■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRNPP04156 253 aa24.58■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 CYP51A1Q16850 503 aa24.58■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 MSRB2Q9Y3D2 182 aa24.58■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 GLYATL1Q969I3 302 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TESCQ96BS2 214 aa24.57■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC72A6NJI9 287 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 INPP4BO15327 924 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 CTSKP43235 329 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 DPY19L1Q2PZI1 675 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF220Q5VTB9 566 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG9BQ674R7 924 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZVL8 140 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 AMIGO2Q86SJ2 522 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 LIX1Q8N485 282 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TMIEQ8NEW7 156 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENOMQ8WWX9 145 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC138Q96M89 665 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.56■■□□□ 1.52
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