RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1E3Q8WZA6 343 aa27.38■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DMRT3Q9NQL9 472 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 MOSPD1Q9UJG1 213 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52E6Q96RD3 313 aa27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALG2Q9H553 416 aa27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADGRE2Q9UHX3 823 aa27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAPRE3Q9UPY8 281 aa27.37■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC01555Q8NAE3 123 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2L8Q8NGY9 312 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 EGLN2Q96KS0 407 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNH6Q9H252 994 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 RHBGQ9H310 441 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 NT5DC2Q9H857 520 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ASMTP46597 345 aa27.35■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LRIF1Q5T3J3 769 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYT12Q8IV01 421 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 AQP12AQ8IXF9 295 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDXPQ96GD0 296 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRDQ9H2X0 955 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 RMND5AQ9H871 391 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CA5BQ9Y2D0 317 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 AP3M1Q9Y2T2 418 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 GAS6Q14393 721 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM31Q5JXX7 168 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPM1MQ96MI6 270 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM15Q9C019 465 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 SERHLQ9NQF3 203 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRDM8Q9NQV8 689 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 VAPAQ9P0L0 249 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDZK1P1A8MUH7 402 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV4-34P06331 123 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.972e-7■■■■□ 21.6
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3KBP1Q96B97 665 aa27.33■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DMTF1Q9Y222 760 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A096LPI6 279 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 OXTRP30559 389 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 NUDT1P36639 197 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGBD3Q8N328 593 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR8J2Q8NGG1 315 aa27.33■■□□□ 1.96
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