RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GPR22	Q99680	433 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PEX12	O00623	359 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KLHL18	O94889	574 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MST1	P26927	711 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NDUFS1	P28331	727 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PGGT1B	P53609	377 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TAS2R39	P59534	338 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	POU4F1	Q01851	419 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TLE4	Q04727	773 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SSPN	Q14714	243 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PAFAH2	Q99487	392 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	HMX2	A2RU54	273 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PCDH17	O14917	1159 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	MATN4	O95460	622 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	INHBA	P08476	426 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CDH3	P22223	829 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	HSD17B3	P37058	310 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	FOLR3	P41439	243 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ART1	P52961	327 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	FAM60A	Q9NP50	221 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ASF1A	Q9Y294	204 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222		C9J4A7	227 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	UNC5C	O95185	931 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TSPAN12	O95859	305 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SHBG	P04278	402 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SAT1	P21673	171 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	GCA	P28676	217 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	MSH2	P43246	934 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	RGS4	P49798	205 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	IL2	P60568	153 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	KRT33B	Q14525	404 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ZNF460	Q14592	562 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.19	□□□□□ -0.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms