RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	ANXA5	P08758	320 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	HRH2	P25021	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EFNA3	P52797	238 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	DRC3	Q9H069	523 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SLC16A5	O15375	505 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	DDAH2	O95865	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	C8G	P07360	202 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PRR35	P0CG20	571 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CXCR2	P25025	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	RGS4	P49798	205 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CDKN2D	P55273	166 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TBPL1	P62380	186 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CSNK1G2	P78368	415 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MFAP5	Q13361	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SHISA5	Q8N114	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CERS2	Q96G23	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PARVB	Q9HBI1	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936		H0YIG0	161 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PCDH17	O14917	1159 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	BMP10	O95393	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TSPAN12	O95859	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	STATH	P02808	62 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NPPB	P16860	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SOX11	P35716	441 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	AVPR1B	P47901	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SP140	Q13342	867 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TLR1	Q15399	786 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PWWP2A	Q96N64	755 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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