RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 USP30Q70CQ3 517 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 CPXM2Q8N436 756 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 OR2T29Q8NH02 315 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 PYURFQ96I23 114 aa8.26□□□□□ -1.09
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