RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ZFHX3Q15911 3703 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPV9 198 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FAM159BA6NKW6 160 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MYO1CO00159 1063 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CLDN1O95832 211 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 DLGAP3O95886 979 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SLC16A8O95907 504 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 C1QAP02745 245 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CTSBP07858 339 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GSTA2P09210 222 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PNLIPRP1P54315 467 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TAS2R39P59534 338 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CYP2A13Q16696 494 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CYS1Q717R9 158 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TMEM126BQ8IUX1 230 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CEP97Q8IW35 865 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ZNF480Q8WV37 535 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TCTN2Q96GX1 697 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 VPS39Q96JC1 886 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MIPEPQ99797 713 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CPNE1Q99829 537 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 RHOJQ9H4E5 214 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 RUBCNLQ9H714 662 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FANCEQ9HB96 536 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PDE10AQ9Y233 779 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 DYRK3O43781 588 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SCRG1O75711 98 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TSPAN12O95859 305 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SLC12A2P55011 1212 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PHKG1Q16816 387 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FCRL6Q6DN72 434 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 OR2L3Q8NG85 312 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SMPDL3AQ92484 453 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 RBBP8Q99708 897 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PARVBQ9HBI1 364 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TAC3Q9UHF0 121 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PADI1Q9ULC6 663 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 NFU1Q9UMS0 254 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 NF1P21359 2839 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 E7ENX8 843 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 E7EQ34 232 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CDC7O00311 574 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SLC16A5O15375 505 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ZNF749O43361 778 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 NRP2O60462 931 aa9.22□□□□□ -0.93
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