RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CD300AQ9UGN4 299 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 PPT2Q9UMR5 302 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 AK5Q9Y6K8 562 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ZNF839A8K0R7 811 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ISM1B1AKI9 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 KLK1P06870 262 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 GSK3BP49841 420 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 RAB28P51157 221 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CLDN8P56748 225 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ALG11Q2TAA5 492 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ATG9BQ674R7 924 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 SYT13Q7L8C5 426 aa8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 OR10A6Q8NH74 314 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 TSPEARQ8WU66 669 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 LCN9Q8WX39 176 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 GTF2H4Q92759 462 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 REPS1Q96D71 796 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 GUCD1Q96NT3 240 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 RMI1Q9H9A7 625 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 PCDH7O60245 1069 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 C1QCP02747 245 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 MT-ND1P03886 318 aa8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 THEGLP0DJG4 465 aa8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 PEX2P28328 305 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 TEAD1P28347 426 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 VHLP40337 213 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 KIR3DL1P43629 444 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 PLA2G16P53816 162 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 MC1RQ01726 317 aa8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 KRT78Q8N1N4 520 aa8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 F2RL3Q96RI0 385 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 HAUS8Q9BT25 410 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 MENTQ9BUN1 341 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 KLF15Q9UIH9 416 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PPV9 198 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 H3BNX3 289 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 RFXANKO14593 260 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 PPM1DO15297 605 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 LAMP1P11279 417 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ATP6V1B2P21281 511 aa8.09□□□□□ -1.11
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CS-215ENST00000549143 CDKN2CP42773 168 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CCR8P51685 355 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CASP9P55211 416 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 DMPKQ09013 629 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 22.2
CS-215ENST00000549143 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 CLECL1Q8IZS7 167 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-215ENST00000549143 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
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