RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545440.5

SNHG1-223, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 754 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-223	ENST00000545440	PTK6	Q13882	451 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ERV3-1	Q14264	604 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PPP1R7	Q15435	360 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ZIC1	Q15915	447 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	UGT8	Q16880	541 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	NEPRO	Q6NW34	567 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	TTC23L	Q6PF05	361 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CENPU	Q71F23	418 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	TRIM73	Q86UV7	250 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	GPR135	Q8IZ08	494 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ZBTB2	Q8N680	514 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CALML6	Q8TD86	181 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	THAP4	Q8WY91	577 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	MR1	Q95460	341 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	FOPNL	Q96NB1	174 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	NLN	Q9BYT8	704 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CHST8	Q9H2A9	424 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	FAM60A	Q9NP50	221 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	TCFL5	Q9UL49	500 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SCN2A	Q99250	2005 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	NBAS	A2RRP1	2371 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ESYT3	A0FGR9	886 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CTAGE9	A4FU28	777 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	USP27X	A6NNY8	438 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440		C9J4A7	227 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440		E5RI56	91 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440		J3QKU1	62 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ZNF749	O43361	778 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SLC28A2	O43868	658 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	RFPL1	O75677	317 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	MATN4	O95460	622 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	C1orf105	O95561	183 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	FAM153B	P0C7A2	387 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ERG	P11308	486 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PGAM1	P18669	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	MAG	P20916	626 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	FMO4	P31512	558 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SLC1A2	P43004	574 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	BDKRB1	P46663	353 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	IL10RA	Q13651	578 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	NAA25	Q14CX7	972 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	NCF4	Q15080	339 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	LONRF1	Q17RB8	773 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CNST	Q6PJW8	725 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	PCGF5	Q86SE9	256 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	KCNJ9	Q92806	393 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	IL17F	Q96PD4	163 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-223	ENST00000545440	RUFY1	Q96T51	708 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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