RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD274Q9NZQ7 290 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C3orf18Q9UK00 162 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DHRS7Q9Y394 339 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUP155O75694 1391 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUP160Q12769 1436 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.89□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A087WZ62 844 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00587B1AMM8 73 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLIC2O15247 247 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC31A2O15432 143 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSPA12AO43301 675 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF208O43345 1280 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LANCL1O43813 399 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CST8O60676 142 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC16A8O95907 504 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFB10O96000 172 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIGRP01833 764 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PGK2P07205 417 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HMBSP08397 361 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIM49P0CI25 452 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIM49CP0CI26 452 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRFP11831 508 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GABRB1P18505 474 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADRA2CP18825 462 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB6AP20340 208 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UGT1A1P22309 533 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ETV4P43268 484 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LIMS1P48059 325 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CXCR3P49682 368 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SOX8P57073 446 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLF10Q13118 480 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IFI44LQ53G44 452 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLHL12Q53G59 568 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP43Q70EL4 1123 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCTD1Q719H9 257 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 S100PBPQ96BU1 408 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM89AQ96GI7 184 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BTBD9Q96Q07 612 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 INPP5KQ9BT40 448 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 S1PR5Q9H228 398 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GANQ9H2C0 597 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POT1Q9NUX5 634 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PKP3Q9Y446 797 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.88□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAP3K1Q13233 1512 aa6.87□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms