RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 MORN1Q5T089 497 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 ASB15Q8WXK1 588 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 TMCO6Q96DC7 493 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 AP2A2O94973 939 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 TAS2R39P59534 338 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 RBPJQ06330 500 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 TMEM198Q66K66 360 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 BICRALQ6AI39 1079 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 SPATC1Q76KD6 591 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 TMEM110Q86TL2 294 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 LPGAT1Q92604 370 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 HAVCR1Q96D42 359 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 OR51B5Q9H339 312 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 RMI1Q9H9A7 625 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 ARSAP15289 507 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 DPP6P42658 865 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 GDF10P55107 478 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 IRF9Q00978 393 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 HMGCS1Q01581 520 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 SERINC3Q13530 473 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 IL18Q14116 193 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 FRG2Q64ET8 278 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 NATD1Q8N6N6 113 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 FRG2BQ96QU4 278 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 PRODH2Q9UF12 536 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 IRF5Q13568 498 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 BORCS8Q96FH0 119 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 CHID1Q9BWS9 393 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 ASB6Q9NWX5 421 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 WASF3Q9UPY6 502 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.09□□□□□ -1.11
GATB-212ENST00000515564 DAPL1A0PJW8 107 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 CXCR6O00574 342 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 PIRO00625 290 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 BCKDKO14874 412 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 GPR37L1O60883 481 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 STARP49675 285 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 SCN1BQ07699 218 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 QPRTQ15274 297 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 FAM47BQ8NA70 645 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 THEM6Q8WUY1 208 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 RAB21Q9UL25 225 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 PLD2O14939 933 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 NUDT17P0C025 328 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 PRKAR1AP10644 381 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 OGDHQ02218 1023 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 GBX1Q14549 363 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 MANEAQ5SRI9 462 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 ZNF627Q7L945 461 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 C14orf80Q86SX3 495 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 TRABD2AQ86V40 505 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.08□□□□□ -1.12
GATB-212ENST00000515564 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.08□□□□□ -1.12
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