RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SERHL2Q9H4I8 314 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SERHLQ9NQF3 203 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 POLE4Q9NR33 117 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HCSTQ9UBK5 93 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 LY75O60449 1722 aa12.86□□□□□ -0.35
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SPCS3-201ENST00000503362 FGBP02675 491 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 LUZP2Q86TE4 346 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TEX26Q8N6G2 289 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 C10orf53Q8N6V4 93 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ABHD11Q8NFV4 315 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 RHBDF1Q96CC6 855 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 DIRAS2Q96HU8 199 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 E2F3O00716 465 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 NME6O75414 186 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CTNNB1P35222 781 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TAS2R41P59536 307 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SPIN4Q56A73 249 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CTSL3PQ5NE16 218 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TPRG1LQ5T0D9 272 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CDC73Q6P1J9 531 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 Q6ZSR9 355 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CLECL1Q8IZS7 167 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC43A3Q8NBI5 491 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PTGFRNQ9P2B2 879 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 RHCGQ9UBD6 479 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 AASSQ9UDR5 926 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 RNF6Q9Y252 685 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TRBC2A0A5B9 178 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CASKO14936 926 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 VIPP01282 170 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CEP78Q5JTW2 689 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MANEALQ5VSG8 457 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC22A15Q8IZD6 547 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 UBE2J2Q8N2K1 259 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 RAD51AP1Q96B01 352 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 LGALS12Q96DT0 336 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 IGSF21Q96ID5 467 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CEP295NLQ96MC4 621 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 EFCAB11Q9BUY7 163 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 FAIMQ9NVQ4 179 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SRRDQ9UH36 339 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 POFUT2Q9Y2G5 429 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 C6orf47O95873 294 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 20.6
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC22A17Q8WUG5 538 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 APIPQ96GX9 242 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HEBP1Q9NRV9 189 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF232Q9UNY5 417 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 LRRC37AA6NMS7 1700 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ARNTLO00327 626 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 AP3D1O14617 1153 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PI15O43692 258 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MPZL2O60487 215 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 FUT4P22083 530 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PNLIPRP1P54315 467 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TAS2R50P59544 299 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 NCS1P62166 190 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HEPACAMQ14CZ8 416 aa12.84□□□□□ -0.35
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SPCS3-201ENST00000503362 USP30Q70CQ3 517 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SPARTQ8N0X7 666 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 OCEL1Q9H607 264 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 GPRC5BQ9NZH0 403 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ISM1B1AKI9 464 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 OR1F1O43749 312 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 QPRTQ15274 297 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 BRAT1Q6PJG6 821 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 NUDT8Q8WV74 236 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLCO4A1Q96BD0 722 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 WDR70Q9NW82 654 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
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