RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	MC5R	P33032	325 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRT20	P35900	424 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAPG	P40121	348 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR3A2	P47893	321 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PGF	P49763	221 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	KYNU	Q16719	465 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	IL16	Q14005	1332 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC1A7	O00341	560 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ERCC2	P18074	760 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACHE	P22303	614 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PDHA2	P29803	388 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SFTPD	P35247	375 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SOX3	P41225	446 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCDC1	P59894	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	DLK1	P80370	383 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPC2	Q8N158	579 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PSMB7	Q99436	277 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RNF121	Q9H920	327 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PI15	O43692	258 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	TBX10	O75333	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CPT2	P23786	658 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PIK3R1	P27986	724 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPP5C	P53041	499 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	IRX4	P78413	519 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	DHODH	Q02127	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PAX8	Q06710	450 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	MTF1	Q14872	753 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RASA2	Q15283	850 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBBP7	Q16576	425 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SURF4	O15260	269 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	GGPS1	O95749	300 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	GSR	P00390	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	HSPA4	P34932	840 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CSRP3	P50461	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CACNG1	Q06432	222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	LY6D	Q14210	128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	FN3K	Q9H479	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1W2PPK0	400 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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