RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TNFRSF4P43489 277 aa16.13■□□□□ 0.17
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TOM1-216ENST00000492723 CALHM3Q86XJ0 350 aa16.13■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 OR8J2Q8NGG1 315 aa16.13■□□□□ 0.17
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TOM1-216ENST00000492723 GBAP04062 536 aa16.11■□□□□ 0.17
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TOM1-216ENST00000492723 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.11■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 CLIC1O00299 241 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PLOD2O00469 737 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PRKD3O94806 890 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ACP5P13686 325 aa16.1■□□□□ 0.17
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