RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 C4orf51C9J302 202 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 F8W8V4 182 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MAP2K7O14733 419 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 KPNA5O15131 536 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 RDH16O75452 317 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 AHSGP02765 367 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ALBP02768 609 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CATP04040 527 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PRR35P0CG20 571 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CDH1P12830 882 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 IVDP26440 423 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MST1P26927 711 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ATP5DP30049 168 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SLC26A3P40879 764 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CCNFP41002 786 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 BCL6P41182 706 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CSNK1G2P78368 415 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CDK16Q00536 496 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 OCA2Q04671 838 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 LONRF1Q17RB8 773 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MUM1Q2TAK8 710 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 BBS9Q3SYG4 887 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 C4orf22Q6V702 233 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MCUQ8NE86 351 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 LINGO1Q96FE5 620 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 AGAP4Q96P64 663 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 OR4K3Q96R72 315 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 TCF12Q99081 682 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 NPAS2Q99743 824 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PSAT1Q9Y617 370 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 TP73O15350 636 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 LRRTM2O43300 516 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ZG16O60844 167 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 GUCA1CO95843 209 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 TSPAN12O95859 305 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 WDPCPO95876 746 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 HPP00738 406 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ALPPP05187 535 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 HEXBP07686 556 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MPC1LP0DKB6 136 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MLNP12872 115 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PAMP19021 973 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SAT1P21673 171 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SOX11P35716 441 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 DCTP40126 519 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ELK3P41970 407 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MFAP5Q13361 173 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 NAE1Q13564 534 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 DSG2Q14126 1118 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R7Q15435 360 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 KCNJ9Q92806 393 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 TSLPQ969D9 159 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PEX11GQ96HA9 241 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 PBKQ96KB5 322 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 IP6K3Q96PC2 410 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC3-211ENST00000491581 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.43□□□□□ -1.06
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