RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 FHL5Q5TD97 284 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA0408Q6ZU52 694 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PCGF5Q86SE9 256 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PSMF1Q92530 271 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM184CQ9NVA4 438 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TAS2R13Q9NYV9 303 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TRPC4Q9UBN4 977 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 I3L1I5 382 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL18O94889 574 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 C8GP07360 202 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SYT16Q17RD7 645 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 BBS9Q3SYG4 887 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 UGT3A1Q6NUS8 523 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC138Q96M89 665 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 AGAP4Q96P64 663 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SGPP1Q9BX95 441 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 DRC3Q9H069 523 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PARVBQ9HBI1 364 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF160Q9HCG1 818 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TEX264Q9Y6I9 313 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 FANCGO15287 622 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 STATHP02808 62 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CSNK1G2P78368 415 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SP140Q13342 867 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 MORF4L2Q15014 288 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 NR6A1Q15406 480 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 STEAP4Q687X5 459 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 AGTRAPQ6RW13 159 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ADCK2Q7Z695 626 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 AMER2Q8N7J2 671 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 MCOLN3Q8TDD5 553 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SLC29A3Q9BZD2 475 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 C14orf105Q9NVL8 296 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TXNDC9O14530 226 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 MAP2K7O14733 419 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 SLC16A5O15375 505 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 AGFG2O95081 481 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ELK3P41970 407 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 EMP2P54851 167 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS41Q7RTY9 318 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TM4SF19Q96DZ7 209 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 LINGO1Q96FE5 620 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 CAPZA3Q96KX2 299 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ATG10Q9H0Y0 220 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 FDXRP22570 491 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 HRH2P25021 359 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 RGS4P49798 205 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM205Q6UW68 189 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFAF7Q7L592 441 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 VPS50Q96JG6 964 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 OLFM1Q99784 485 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 MACROD1Q9BQ69 325 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM51Q9BSJ1 452 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 MAP10Q9P2G4 905 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 CHMP2BQ9UQN3 213 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 NPPBP16860 134 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 SOX11P35716 441 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 MFAP5Q13361 173 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ISLR2Q6UXK2 745 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 OR9A4Q8NGU2 314 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PCBD2Q9H0N5 130 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 IKZF3Q9UKT9 509 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 BMP10O95393 424 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 CELA2AP08217 269 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PRR35P0CG20 571 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 BCL6P41182 706 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TSFMP43897 325 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 GLRBP48167 497 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 NAE1Q13564 534 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PCOLCEQ15113 449 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms