RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.17□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 INTUQ9ULD6 942 aa6.17□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 BTRCQ9Y297 605 aa6.17□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.17□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ALG6Q9Y672 507 aa6.17□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 OR6C74A6NCV1 312 aa6.16□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 HACD1B0YJ81 288 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 H3BMH7 237 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 AKR1B10O60218 316 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 DYNLT1P63172 113 aa6.16□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 GTF2H3Q13889 308 aa6.16□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PID1Q7Z2X4 250 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 DSELQ8IZU8 1212 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GDAP1Q8TB36 358 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PPM1MQ96MI6 270 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.423e-9■□□□□ 11.2
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PRPF40A-210ENST00000489741 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PKP3Q9Y446 797 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ARL5AQ9Y689 179 aa6.16□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 C5orf60A6NFR6 353 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 WIPF3A6NGB9 483 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.15□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 PSTPIP1O43586 416 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 MFAP3LO75121 409 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SCRG1O75711 98 aa6.15□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 MSH3P20585 1137 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GNLYP22749 145 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMA3P25788 255 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 HSD3B2P26439 372 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFS1P28331 727 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CCL11P51671 97 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GSDMDP57764 484 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ABRQ12979 859 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 XRCC4Q13426 336 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBA3CQ13748 450 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 LLGL1Q15334 1064 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NADK2Q4G0N4 442 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.15□□□□□ -1.42
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