RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 IFNB1P01574 187 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 IGLV2-11P01706 119 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PRSS1P07477 247 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SBK2P0C263 348 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MYL6BP14649 208 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 EPCAMP16422 314 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CA4P22748 312 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 JAK1P23458 1154 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RABIFP47224 123 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SLC26A5P58743 744 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ZNF415Q09FC8 603 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 VEZF1Q14119 521 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TAF13Q15543 124 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SGCBQ16585 318 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 UGP2Q16851 508 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CDO1Q16878 200 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 WSCD2Q2TBF2 565 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KLHL22Q53GT1 634 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 STPG1Q5TH74 334 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KDELC1Q6UW63 502 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ISCA2Q86U28 154 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FAM219AQ8IW50 185 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FBXO30Q8TB52 745 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 UHRF2Q96PU4 802 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SYTL2Q9HCH5 934 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SCN5AQ14524 2016 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 C5orf52A6NGY3 159 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RASGRF2O14827 1237 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TTI1O43156 1089 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PEX11AO75192 247 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RAD51DO75771 328 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MT-ATP6P00846 226 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G4BP0C869 781 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 IRF2P14316 349 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SERPINB6P35237 376 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DLK1P80370 383 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 NPTX1Q15818 432 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 AARDQ4LEZ3 155 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SPDYCQ5MJ68 293 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SLC35E4Q6ICL7 350 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CDK20Q8IZL9 346 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 STPG4Q8N801 248 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 BMPERQ8N8U9 685 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 OCC1Q8TAD7 63 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SPATA18Q8TC71 538 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 URGCPQ8TCY9 931 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FGF21Q9NSA1 209 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 LRP12Q9Y561 859 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PPK0 400 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ATP6V0E1O15342 81 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CIDEAO60543 219 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SELENOFO60613 162 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SLC16A8O95907 504 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KRT13P13646 458 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ETS1P14921 441 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 VCLP18206 1134 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CA6P23280 308 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 HSD17B3P37058 310 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FRKP42685 505 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CAMLGP49069 296 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 GALK2Q01415 458 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KLC1Q07866 573 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.53□□□□□ -1.68
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