RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		A0A087X0T9	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BTN3A1	O00481	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SHOX	O15266	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SPOP	O43791	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	USP1	O94782	785 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MBD3	O95983	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FTH1	P02794	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RPN2	P04844	631 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CAPN1	P07384	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	STS	P08842	583 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM228B	P0C875	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TNNT1	P13805	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FDXR	P22570	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MMP11	P24347	488 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PTPN3	P26045	913 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CTNNA2	P26232	953 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RAB28	P51157	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SMS	P52788	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ARG2	P78540	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MVK	Q03426	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OCA2	Q04671	838 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRKG2	Q13237	762 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RBBP7	Q16576	425 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LMF1	Q96S06	567 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WDR54	Q9H977	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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