RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MANBA	O00462	879 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AREL1	O15033	823 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LEFTY1	O75610	366 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TACR1	P25103	407 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAPK8	P45983	427 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CSNK1D	P48730	415 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPINT3	P49223	89 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BNIP2	Q12982	314 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OXA1L	Q15070	435 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CARM1	Q86X55	608 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HID1	Q8IV36	788 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EGLN2	Q96KS0	407 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GRM6	O15303	877 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAS	P25445	335 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BMPR1A	P36894	532 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ACOX3	O15254	700 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WDR47	O94967	919 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	APOA1	P02647	267 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTSL	P07711	333 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTPN2	P17706	415 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COQ5	Q5HYK3	327 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MICU2	Q8IYU8	434 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TSSK3	Q96PN8	268 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278		I3L521	148 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RGS5	O15539	181 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UBE3A	Q05086	875 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXM1	Q08050	763 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ERAP2	Q6P179	960 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RGS14	O43566	566 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANXA5	P08758	320 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AOAH	P28039	575 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ELK4	P28324	431 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PREP	P48147	710 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ABR	Q12979	859 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CAMK1	Q14012	370 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms