RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479499.1

LAMC1-204, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 3

Gene LAMC1, Length 700 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-204ENST00000479499 PAK5Q9P286 719 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 E7ENX8 843 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 VPS26AO75436 327 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MGAT1P26572 445 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 NPY2RP49146 381 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 PNLIPRP1P54315 467 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 TAP2Q03519 686 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 RELAQ04206 551 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ZNF33BQ06732 778 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 KIF5AQ12840 1032 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 NAA25Q14CX7 972 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 C3AR1Q16581 482 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CENPUQ71F23 418 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CCDC89Q8N998 374 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 NPAS2Q99743 824 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 HES7Q9BYE0 225 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 STMN3Q9NZ72 180 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MED16Q9Y2X0 877 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 A8MUI8 341 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 C19orf84I3L1E1 186 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MAN1A2O60476 641 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SLC19A2O60779 497 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ESR1P03372 595 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 UQCRHP07919 91 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ANXA5P08758 320 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ICAM2P13598 275 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CHRM3P20309 590 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 PTGER4P35408 488 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CLCN7P51798 805 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 FAM53BQ14153 422 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 RPTNQ6XPR3 784 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 BEST3Q8N1M1 668 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 TCF12Q99081 682 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CYTH2Q99418 400 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 BFARQ9NZS9 450 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 TINAGQ9UJW2 476 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MED13LQ71F56 2210 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 H3BMM5 538 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 H7BY64 318 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SMAPO00193 183 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ZNHIT1O43257 154 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 AVILO75366 819 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CATP04040 527 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 PKMP14618 531 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 KRTAP10-9P60411 292 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CCNG2Q16589 344 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ZNF766Q5HY98 468 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ACER2Q5QJU3 275 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 PLAG1Q6DJT9 500 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 ZNF549Q6P9A3 640 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 CILP2Q8IUL8 1156 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-204ENST00000479499 MDS2Q8NDY4 140 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms