RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 LCTLQ6UWM7 567 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 C17orf64Q86WR6 236 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 IQCKQ8N0W5 287 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ATL1Q8WXF7 558 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 AGAP4Q96P64 663 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 SGPP1Q9BX95 441 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 LHPPQ9H008 270 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ARL15Q9NXU5 204 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ZFATQ9P243 1243 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 E7ESA3 106 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 H0YIG0 161 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 MASP2O00187 686 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 TSPAN12O95859 305 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 CXCR2P25025 360 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 AVPR1BP47901 424 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 CSNK1G2P78368 415 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NAE1Q13564 534 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PHKG1Q16816 387 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ATG9BQ674R7 924 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 DUPD1Q68J44 220 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PLD3Q8IV08 490 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 AMER3Q8N944 861 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD7Q92527 254 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 KRT12Q99456 494 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 LUZP4Q9P127 313 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 FAM187AA6NFU0 413 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 IDSB3KWA1 339 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 TP73O15350 636 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 P2RX6O15547 441 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 FOXS1O43638 330 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NPPBP16860 134 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 CALCOCO2Q13137 446 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 Q6ZS92 163 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 OR56A3Q8NH54 315 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 FBXL8Q96CD0 374 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 OLFM1Q99784 485 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 MAP10Q9P2G4 905 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 SNX24Q9Y343 169 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 A0A1W2PQ72 361 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ALOX12BO75342 701 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 HEXBP07686 556 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 CYC1P08574 325 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 GNLYP22749 145 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 LMF1Q96S06 567 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 WHRNQ9P202 907 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-205ENST00000467594 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.064e-8■■□□□ 11.4
NISCH-205ENST00000467594 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms