RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456665.6

PUS1-204, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-204ENST00000456665 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 SLC22A14Q9Y267 594 aa23.1■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 CDH1P12830 882 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 MAGEA12P43365 314 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 SLC6A12P48065 614 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 CDC20Q12834 499 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 DLG1Q12959 904 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 SLC29A2Q14542 456 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NCF4Q15080 339 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 FAM198BQ6UWH4 519 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NXNL1Q96CM4 212 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 CABS1Q96KC9 395 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 ALG9Q9H6U8 611 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 PELI2Q9HAT8 420 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 STARD5Q9NSY2 213 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NDOR1Q9UHB4 597 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 CDC14AQ9UNH5 594 aa23.09■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 WDR47O94967 919 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 CAPN1P07384 714 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 MYBL2P10244 700 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 COL6A2P12110 1019 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 GNAZP19086 355 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NDUFA9Q16795 377 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 C1orf189Q5VU69 101 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 KCTD4Q8WVF5 259 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NEIL2Q969S2 332 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 FKBP10Q96AY3 582 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 PPCSQ9HAB8 311 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 TCFL5Q9UL49 500 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 SH2B3Q9UQQ2 575 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PUS1-204ENST00000456665 NKX2-8O15522 239 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.289e-7■■■■■ 26.8
PUS1-204ENST00000456665 STK16O75716 305 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 ALBP02768 609 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 LCN10Q6JVE6 187 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 CAMKVQ8NCB2 501 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 VPS11Q9H270 941 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 ITPR1Q14643 2758 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TRBC2A0A5B9 178 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 CXCR2P25025 360 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 FAM53BQ14153 422 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 UGT8Q16880 541 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 C16orf46Q6P387 395 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 NXPE4Q6UWF7 544 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 MFSD9Q8NBP5 474 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 THAP4Q8WY91 577 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TTC9Q92623 222 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 AIF1LQ9BQI0 150 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 SUPT3HB4E1H0 165 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TRIM49D1C9J1S8 452 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TAPBPO15533 448 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 SUPT3HO75486 399 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 RBP1P09455 135 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 IRF9Q00978 393 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 CDC16Q13042 620 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 ERV3-1Q14264 604 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 MLIPQ5VWP3 458 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 WDR93Q6P2C0 686 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 BORAQ6PGQ7 559 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 ASPGQ86U10 573 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 PLD3Q8IV08 490 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TM4SF19Q96DZ7 209 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 TMEM79Q9BSE2 394 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 SLC26A1Q9H2B4 701 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 EHD1Q9H4M9 534 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 WDR54Q9H977 334 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 ZNF304Q9HCX3 659 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 POLHQ9Y253 713 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 SLC35G6P0C7Q6 338 aa23.04■■□□□ 1.28
PUS1-204ENST00000456665 PRKAR1AP10644 381 aa23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms