RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451916.1

CLHC1-208, Transcript of clathrin heavy chain linker domain containing 1, human

TSL 3

Gene CLHC1, Length 616 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLHC1-208	ENST00000451916	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	LAMB2	P55268	1798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916		A0A075B6Q4	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916		H7BY64	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	SNAP23	O00161	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PSMD9	O00233	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PDHX	O00330	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	AIM2	O14862	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	SLC30A4	O14863	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PPM1D	O15297	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ZBTB14	O43829	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ENTPD3	O75355	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PRDM1	O75626	825 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PROSC	O94903	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	TDP2	O95551	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	GH2	P01242	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	C1QA	P02745	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	SLPI	P03973	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	GNAO1	P09471	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	RALA	P11233	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	HSD17B1	P14061	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	TCF4	P15884	667 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	SPN	P16150	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ZNF28	P17035	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CHRM3	P20309	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CAPN3	P20807	821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	C4BPB	P20851	252 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PCMT1	P22061	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CPN2	P22792	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	FPR2	P25090	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	S100P	P25815	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	IL1R2	P27930	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	RORA	P35398	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	GSTM5	P46439	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PSME3	P61289	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DSC2	Q02487	901 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CHRND	Q07001	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	EFR3A	Q14156	821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PON2	Q15165	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	BAK1	Q16611	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	MICA	Q29983	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CEP68	Q76N32	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DPP10	Q8N608	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLHC1-208	ENST00000451916	ELMO1	Q92556	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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