RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP6C	O00743	305 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR7A17	O14581	309 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNFSF15	O95150	251 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERPIND1	P05546	499 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ETV5	P41161	510 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	BMPER	Q8N8U9	685 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	STARD5	Q9NSY2	213 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402		B4E171	279 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2B3	O76000	313 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	WFS1	O76024	890 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLDN9	O95484	217 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MLYCD	O95822	493 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OTC	P00480	354 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	STATH	P02808	62 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADRB1	P08588	477 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	BCL6	P41182	706 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSPAN7	P41732	249 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC18A1	P54219	525 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL11RA	Q14626	422 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR1L3	Q8NH93	324 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MDM1	Q8TC05	714 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	USP7	Q93009	1102 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DRC3	Q9H069	523 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRBC2	A0A5B9	178 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402		H0YGG7	62 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	BIRC5	O15392	142 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTSB	P07858	339 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCNA	P12004	261 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD22	P20273	847 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCR10	P46092	362 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGA1	P56199	1179 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB15	P59190	212 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP4F2	P78329	520 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	REEP5	Q00765	189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBCC	Q15814	346 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIPJ	Q5W064	366 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCT6B	Q92526	530 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2A5	Q96R48	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NTMT1	Q9BV86	223 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.1	□□□□□ -0.31

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