RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 SLC25A12O75746 678 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SUN1O94901 812 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 CLDN7O95471 211 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 VCLP18206 1134 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 EPHB2P29323 1055 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 RENBPP51606 427 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 VEZF1Q14119 521 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ETFDHQ16134 617 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ARMC12Q5T9G4 340 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TTI2Q6NXR4 508 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 KDELC1Q6UW63 502 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 BRAPQ7Z569 592 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 NAXEQ8NCW5 288 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 DHX58Q96C10 678 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 LYSMD1Q96S90 227 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 DEF6Q9H4E7 631 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ROS1P08922 2347 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TMEM89A2RUT3 159 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 HSPB2A8KAH6 182 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 DEFB108AA8MXU0 73 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 DVL2O14641 736 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 BCKDKO14874 412 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TCF21O43680 179 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 WDR1O75083 606 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 MTX2O75431 263 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ITGA2P17301 1181 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 BMP5P22003 454 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 UGT1A1P22309 533 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 OR1D4P47884 311 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 GIPRP48546 466 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ATP5J2P56134 94 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 DCDC1P59894 354 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 PLP2Q04941 152 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 HSPB2Q16082 182 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 CAMK4Q16566 473 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 MEP1AQ16819 746 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ZNF569Q5MCW4 686 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ERICH6BQ5W0A0 696 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ZNF585AQ6P3V2 769 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SPESP1Q6UW49 350 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TMEM205Q6UW68 189 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 RRAGAQ7L523 313 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ARCQ7LC44 396 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 CRLF3Q8IUI8 442 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 PGBD5Q8N414 524 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 CCDC185Q8N715 623 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 IQUBQ8NA54 791 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 OR5M9Q8NGP3 310 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 GLYATL1Q969I3 302 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SLC35C1Q96A29 364 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 NTAN1Q96AB6 310 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 MIEF2Q96C03 454 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 NRTNQ99748 197 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 MGME1Q9BQP7 344 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SPATA25Q9BR10 227 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 JKAMPQ9P055 326 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 EML6Q6ZMW3 1958 aa3.04□□□□□ -1.92
PMS1-215ENST00000447232 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.04□□□□□ -1.92
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