RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 LZICQ8WZA0 190 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GLYATL1Q969I3 302 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 MED8Q96G25 268 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 NODALQ96S42 347 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DUSP26Q9BV47 211 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SGK2Q9HBY8 427 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RAD18Q9NS91 495 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GMEB1Q9Y692 573 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GABRR3A8MPY1 467 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 hCG_2039718K7EN88 272 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DIRAS1O95057 198 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 FABP3P05413 133 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ACRP10323 421 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SYN1P17600 705 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 VEGFBP49765 207 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 E2F2Q14209 437 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF77Q15935 545 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 IQCCQ4KMZ1 466 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SYTL3Q4VX76 610 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PKP4Q99569 1192 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CHST8Q9H2A9 424 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf226A1L170 272 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PTGES3LE9PB15 166 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 XPNPEP2O43895 674 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ATG13O75143 517 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 UGT2B11O75310 529 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RFPL2O75678 378 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CATP04040 527 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 FPR1P21462 350 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 VEZF1Q14119 521 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF284Q2VY69 593 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 OR7G3Q8NG95 312 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 IL36AQ9UHA7 158 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 HIDE1A8MVS5 230 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 HTR1BP28222 390 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PDHA2P29803 388 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CRYBA2P53672 197 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ERVFC1P60507 584 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 IL5RAQ01344 420 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 KEAP1Q14145 624 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MOGQ16653 247 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 STARD8Q92502 1023 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GULP1Q9UBP9 304 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 BTNL2Q9UIR0 455 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 BAG5Q9UL15 447 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 EFCAB14O75071 495 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 DNAJB5O75953 348 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MYO1DO94832 1006 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NUDT7P0C024 238 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 HOXA9P31269 272 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MMP12P39900 470 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGDIAP52565 204 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LIPIQ6XZB0 460 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 BORCS5Q969J3 196 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 DKK3Q9UBP4 350 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEB3O15480 346 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SH3BGRLO75368 114 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 INMTO95050 263 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ANGPTL1O95841 491 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 BCL10O95999 233 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 IDSP22304 550 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ASMTP46597 345 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 AQP6Q13520 282 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 Q6ZNX1 250 aa15.44■□□□□ 0.06
SHQ1-202ENST00000444040 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms