RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 GNPDA1P46926 289 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DAPP51397 102 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DGKQP52824 942 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 HERVK_113P63132 956 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 AANATQ16613 207 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LIPIQ6XZB0 460 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 P3H2Q8IVL5 708 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF675Q8TD23 568 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FCGR1BQ92637 280 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MIOSQ9NXC5 875 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ING3Q9NXR8 418 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NFICP08651 508 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL8P10145 99 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KELP23276 732 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT6P53370 316 aa8.15□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 KEAP1Q14145 624 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KANK2Q63ZY3 851 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM192Q8IY95 271 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPEARQ8WU66 669 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.15□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SRRQ9GZT4 340 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PPA2Q9H2U2 334 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ASAH2Q9NR71 780 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MCUBQ9NWR8 336 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01387J3KSC0 135 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 E2F3O00716 465 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DFNA5O60443 496 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SMPD2O60906 423 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 LCP1P13796 627 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PGBD5Q8N414 524 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR5K4A6NMS3 321 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 KLF4O43474 513 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC22BO75396 215 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PTHP01270 115 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF4P08620 206 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TYRP1P17643 537 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DMAP28067 261 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGCLP35914 325 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TKTL1P51854 596 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PER3P56645 1201 aa8.14□□□□□ -1.11
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