RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT10P13645 584 aa4.36□□□□□ -1.71
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.36□□□□□ -1.71
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RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNB1P14635 433 aa4.35□□□□□ -1.71
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RPS3AP54-201ENST00000435535 IL4RP24394 825 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAN1A1P33908 653 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINF1P36955 418 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTR1BP42025 376 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSNK1DP48730 415 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCAR3P49019 387 aa4.35□□□□□ -1.71
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