RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNJ13O60928 360 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PRSS23O95084 383 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PCCBP05166 539 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CHRNB3Q05901 458 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 METRNLQ641Q3 311 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 SERPINA11Q86U17 422 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 EPHX4Q8IUS5 362 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 HDDC3Q8N4P3 179 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 NECTIN4Q96NY8 510 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CHID1Q9BWS9 393 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 IKZF5Q9H5V7 419 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 RMI1Q9H9A7 625 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRE2Q9UHX3 823 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 BTNL2Q9UIR0 455 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ACSL5Q9ULC5 683 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CXCR6O00574 342 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 SOCS2O14508 198 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDH8O95206 1070 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PCNAP12004 261 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CKMT2P17540 419 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 HPCAL1P37235 193 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 RPL3P39023 403 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 STARD3Q14849 445 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 NHSL2Q5HYW2 709 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ANXA8L1Q5VT79 327 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PHC3Q8NDX5 983 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM110BQ8TC76 370 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PHF12Q96QT6 1004 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 GABRG3Q99928 467 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA9Q9BWV2 254 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PCBD2Q9H0N5 130 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ASF1AQ9Y294 204 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PIPSLA2A3N6 862 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ACOX3O15254 700 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 SCN2BO60939 215 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 COX7A2P14406 83 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 WNT3P56703 355 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS21P63220 83 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 RAE1P78406 368 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 C2orf27AQ580R0 203 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 OR4F3Q6IEY1 312 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PGBD3Q8N328 593 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 OR5K2Q8NHB8 316 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 EGLN2Q96KS0 407 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CNBD2Q96M20 576 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 EBPLQ9BY08 206 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR26Q9H7D7 661 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 DMRT3Q9NQL9 472 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 EVPLLA8MZ36 301 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 K7EQS6 105 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PPIBP23284 216 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 GALK1P51570 392 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PLIN5Q00G26 463 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP2A13Q16696 494 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ERICH5Q6P6B1 374 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CBR4Q8N4T8 237 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 TFAP2CQ92754 450 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CENPKQ9BS16 269 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 INPP5KQ9BT40 448 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PIF1Q9H611 641 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 PELI2Q9HAT8 420 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-202ENST00000435136 SAC3D1A6NKF1 404 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 CLOCKO15516 846 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 SERPINB1P30740 379 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS13P62277 151 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 GTDC1Q4AE62 458 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 EID3Q8N140 333 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF175Q8N4F7 328 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS37AQ8NEZ2 397 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 COQ8BQ96D53 544 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF145Q96MT1 663 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-202ENST00000435136 SCML1Q9UN30 329 aa17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms